חיידקים, תרופות ומחלות

קהילת החיידקים המגוונת הנמצאת במעי, הידועה בשם "מיקרוביום המעי", מעורבת במצבי מחלה רבים. בקבוצת המחקר של פרופ' אלחנן בורנשטיין מפתחים כלים חישוביים חדשניים לניתוח ביג דאטה של המיקרוביום על מנת להבין טוב יותר את האינטראקציה בין אוכלוסיית החיידקים לגוף האנושי.

בשנה האחרונה הקבוצה פרסמה שורה של מאמרים בכתב העת היוקרתי Nature Communications בהם, בין השאר, הציגה שיטה חישובית חדשה לזיהוי קבוצות חיידקים ומטבוליטים הקשורים למצבי מחלה, מודל המבוסס על למידת מכונה לחיזוי השפעת תרופות שונות על המיקרוביום, וניתוח סטטיסטי של דאטה מהשתלות צואה שחשף אינטראקציות בין חיידקים שונים.

המאמרים - Nature Communications :

מקדם פיזור יחסי לאחר השתלת מיקרוביוטה צואתית חושף את העקרונות השולטים בדינמיקת הגירה של חיידקים
Relative dispersion ratios following fecal microbiota transplant elucidate principles governing microbial migration dynamics

https://www.nature.com/articles/s41467-024-48717-z -

אינטגרציה רב-אומית של נתוני מיקרוביום לזיהוי מודולים הקשורים למחלה
Multi-omic integration of microbiome data for identifying disease-associated modules

https://www.nature.com/articles/s41467-024-46888-3

גישה מבוססת נתונים לחיזוי ההשפעה של תרופות על המיקרוביום האנושי
A data-driven approach for predicting the impact of drugs on the human microbiome
https://www.nature.com/articles/s41467-023-39264-0